2023年7月,我院石德顺研究员团队在国际top期刊《Journal of Animal Science and Biotechnology》(中科院一区,IF=7.0)在线发表了题为“Whole-genome transcriptome and DNA methylation dynamics of pre-implantation embryos reveal progression of embryonic genome activation in buffaloes”的研究成果,首次从全基因组转录和DNA甲基化水平揭示了水牛早期胚胎发育进程,并揭示了胚胎基因组激活(EGA)机制。
水牛早期胚胎在体外培养发育率较低,容易发生发育阻滞现象,这极大的限制了水牛胚胎生物技术在水牛产业发展中的应用。因此,阐明水牛早期胚胎发育规律及EGA分子调控机制具有重要意义。本研究运用微量细胞RNA-Seq和WGBS技术,首次构建了水牛卵母细胞和早期胚胎全基因组转录图谱和DNA甲基化图谱,揭示了水牛早期胚胎进程,从全基因组水平明确了水牛Major EGA发生在16-cell阶段,通过WGCNA分析进一步阐述了水牛EGA的调控机制,明确了相关调控通路和重要hubgene,并且发现CDK1基因通过细胞周期、细胞分裂、磷酸化和蛋白质定位到核等细胞分子生物过程对水牛胚胎EGA起到了关键性作用。
本研究工作以银河yh8858com为第一通讯单位,银河yh8858com石德顺研究员和中国农科院深圳基因所高飞研究员为通讯作者,伏彭辉博士为第一作者,杨春艳博士、袁翔博士均参与了重要工作。该研究同时得到了刘庆友教授和崔奎青教授的倾心指导。项目得到国家自然基金项目和广西八桂学者创新团队项目资助。
全文链接:https://jasbsci.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40104-023-00894-5
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